diciembre 1, 2022

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El extraño ritmo evolutivo de las mutaciones del SARS-CoV-2 finalmente se revela en un nuevo estudio

. calendario COVID-19 pandemia Estuvo marcado por una serie de olas catastróficas: la propagación de la infección alcanza su punto máximo en todo el mundo, a menudo liderada por variantes recientemente desarrolladas del patógeno, como delta y omicron.

Por supuesto, así es como puede ocurrir la evolución viral. Pero SARS-CoV-2 Es un virus inusualmente exitoso y peligroso; Parte de lo que hace la ‘novela Coronavirus“Tan notable es su novedad constante: el ritmo inusualmente rápido al que parecen multiplicarse las nuevas variantes.

“Lo que estábamos viendo con las variantes del SARS-CoV-2, especialmente las variantes preocupantes, es que sufrieron muchas más mutaciones de las que esperaríamos bajo el ritmo evolutivo normal de coronavirus similares”. explicar Sebastian Duchenne es investigador de enfermedades infecciosas del Instituto Peter Doherty de Infecciones e Inmunología de Australia.

Por lo general, señala Duchenne, virus Tienden a mutar a un ritmo relativamente constante, y puede pasar un año o más hasta que surja una nueva variante viral. Pero el coronavirus no parece ceñirse a ese calendario.

“Los variable deltapor ejemplo, apareció dentro de solo seis semanas de su forma ancestral “. Duchene dice.

en nuevo estudioDuchene y sus colegas investigadores buscaron investigar de dónde proviene este marco de tiempo dramáticamente acelerado.

Analizaron los datos de la secuencia del genoma del SARS-CoV-2 para examinar cómo variables preocupantes (COV, linajes más virulentos) pueden estar asociados con cambios en tasa de reemplazo de virus: la velocidad a la que aparecen nuevas mutaciones en el código genético de un patógeno.

Según los investigadores, la tasa de sustitución posterior del SARS-CoV-2 indica que el virus acumula aproximadamente dos mutaciones por mes.

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Pero los VOC son una bestia diferente, con variantes como Alpha, Beta, Gamma y Delta que obtienen muchas mutaciones en períodos de tiempo relativamente cortos, cada uno de los cuales puede alterar cosas como el contagio de variantes, la capacidad de replicación, el nivel de condición física, etc. .

“La gran cantidad de mutaciones observadas en estos cuatro VOC es mucho más alta de lo que se esperaría según las estimaciones filogenéticas de la tasa de evolución de nucleótidos del SARS-CoV-2”, dijeron los investigadores. Explicación en su papel.Dirigido por el primer autor John Tay, investigador de bioinformática en el Instituto Doherty.

Según el equipo, el secreto de la mutación acelerada de los COV no es un fenómeno continuo, sino algo que parece ocurrir temporalmente en la evolución del virus, poco antes de que surjan las variantes.

“Encontramos pruebas convincentes de que los aumentos episódicos, en lugar de aumentos prolongados en la tasa de sustitución, respaldan la aparición de COV”. el equipo escribe.

La tasa incremental de sustituciones es aproximadamente cuatro veces mayor que la tasa de evolución de fondo estimada para el SARS-CoV-2, pero el análisis indica que la acumulación de mutaciones ocurre en un estallido compacto: quizás cuatro semanas menos para la variante beta y seis semanas para la variante delta.

Otras variantes tardaron más, ya que se cree que la variante gamma se desarrolló durante 17 semanas, mientras que la alfa requirió 14 semanas.

Así es como sucede, pero en cuanto a por qué ocurren estas mutaciones, no estamos del todo seguros.

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Los investigadores dicen que la aparición de compuestos orgánicos volátiles es Posiblemente impulsado por la selección natural. Otros factores relevantes podrían incluir la infección en la población no vacunada, lo que puede permitir que el virus se propague y evolucione más fácilmente, y la infección persistente en ciertas personas, como los pacientes inmunocomprometidos, que también puede conducir a Cambiando la dinámica viral.

Aunque todavía hay mucho que no entendemos completamente sobre qué desencadena tantas mutaciones rápidas en el SARS-CoV-2, el hecho de que podamos ver y rastrear esta ocurrencia significa que el monitoreo genético continuo del virus es fundamental.

Hacerlo puede darnos la oportunidad de detener la próxima ola, en lugar de atraparla.

“Eso hace que el caso de la vigilancia genética sea muy bueno, porque no detectamos las formas intermedias de Omicron, y ciertamente hubo un poco”, dijo Duchenne. Heraldo de la mañana de Sídney.

“Imagínese si pudiera detectar Omicron en los primeros pacientes; si pudiera evitar que se propague desde allí, no estaríamos en la situación en la que nos encontramos ahora”.

Los resultados se informan en Biología molecular y evolución..